雲林縣政府於民國87年爭取台大在雲林分設工學院、醫學院、農學院等,並撥用高鐵特定區50公頃土地及貸款8億元給台大做利用,等待17年後,設校可能性逐漸下降,台大也只動工完成台大雲林分院虎尾院區及宿舍、停車場共7公頃,讓雲林縣府從原先的期待轉為失望。
雲林縣長李進勇於專案會議中表示台大應斟酌目前狀況,盡可能規劃出務實的方向以便縣府配合。縣府官員則表示,台大醫院雲林分院目前僅有400床,一位難求的狀況天天都在上演,若台大對設分校有困難,至少增加床位至700床,提供雲林縣民眾更好的醫療服務。
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